lubuntu14.04でやってみた
まずはあんていの安定のapt-get
windowsならchocolateyで入るらしいです
sudo apt-get pandoc
実行するときは(Windows)
pandoc %* -o %~n1.pdf -V documentclass=ltjarticle -V geometry:a4paper --latex-engine=lualatex
linux
pandoc $1 -o ${1%.*}.pdf -V documentclass=ltjarticle -V geometry:a4paper --latex-engine=lualatex